Федеральный судья.
С 30.11.2006 - председатель Мещанского районного суда г. Москвы, с 2009 - судья. ("председатель Мещанского суда не справился с административной работой. Очень мягким человеком оказался, спросить с других не мог. Он остался судьей того же суда").
Ранее - судья Таганского районного суда Москвы.
Наиболее громкие процессы, прошедшие под председательством Прощенко:
Отказал в регистрации ряда политических партий накануне выборов-2003 (НБП, Республиканской и т.д.).
Решил окончательно отстранить от должности мэра Пущино Анатолия Афанаскина за взятки.
Приговорил к 9 годам создателя и руководителя потребительского ипотечного кооператива (ПИК) "Общее дело" Николая Пищикова
Судил дело Митволя против Жириновского по поводу Лужкова.
Владимир Прощенко и запрещенное искусство
28 марта 2005 в Таганском районном суде Москвы федеральный судья Владимир Прощенко признал виновными организаторов выставки "Осторожно, религия!" - директора Сахаровского центра Юрия Самодурова и сотрудницу музея Людмилу Василовскую по частям 1 и 2 статьи 282 УК РФ.
Судья назначил обоим подсудимым наказание в виде штрафа в размере 100 тысяч рублей.
Прокурор Кира Гудим требовала реальных сроков заключения: Юрию Самодурову – три года, Людмиле Василовской и художнице Анне Михальчук (признанной судом невиновной) – по два.